Pozůstatky tvrze Božejovice se nacházejí asi 5 km severozápadně od Protivína v sousedství vsi Skály na ostrohu vybíhajícím do Tvrzského rybníka.

Počátkem 15. století byla majetkem Jaroše z Drahenic. Roku 1433 tvrz dobyl Oldřich z Rožmberka. Posledním vlastníkem byl Mikuláš Radkovec z Mirovic, který ji ponechal svému osudu. V roce 1741 je již uváděna jako pustá.
Dnes je do pozůstatků tvrze vestavěno obytné stavení.

U tvrze je zastavení naučné stezky Okolo Blanice, která prochází okolo.